Ефективність застосування методу GenoType MTBDRplus у діагностиці туберкульозу в Запорізькій області

R. M. Yasinskyi, O. M. Raznatovska, O. V. Konakova, O. M. Kamyshnyi, N. A. Rokhmanova, A. V. Klymenko, Jean-Luc Berland, Marie Gauhier

Анотація


Метод GenoType MTBDRplus 2 версії (GenoType MTBDRplus, v.2) дає можливість досліджувати клінічний матеріал із позитивних і негативних мазків, обстежувати хворих із новими та повторними випадками туберкульозу легень і позалегеневої локалізації. Але нині кількість досліджень щодо використання цього методу в діагностиці туберкульозу невелика.

Мета роботи – оцінити ефективність застосування методу дослідження клінічного матеріалу з використанням методу GenoType MTBDRplus, v.2 у діагностиці туберкульозу в Запорізькій області порівняно зі стандартними методами дослідження.

Матеріали та методи. Здійснили аналіз 52 результатів досліджень клінічного матеріалу за допомогою тест-системи GenoType MTBDRplus, v.2 від пацієнтів, які обстежувалися та лікувалися в диспансерах Запорізької області у 2016 році. Серед пацієнтів було 67,3 % чоловіків і 32,7 % жінок. Середній вік хворих становив 46,0 ± 1,9 року. Дослідження клінічного матеріалу з використанням тесту GenoType MTBDRplus, v.2 здійснили за стандартом, відповідно до інструкції виробника.

Результати. При негативних результатах мікроскопії клінічного матеріалу у 12,5 % випадках результати виявилися позитивними під час дослідження за допомогою методу GenoType MTBDRplus, v.2 (р ˂ 0,05). Частка збігів між культуральним і молекулярно-генетичним методами становила 90 % для харкотиння та 100 % для іншого клінічного матеріалу. За наявності мультирезистентності обидва методи дослідження майже збігалися за кількістю виявлених випадків (50,0 % для методу GenoType MTBDRplus, v.2 та 42,9 % для культурального методу відповідно, р ˃ 0,05). Порівняно з результатами культурального методу, тест  GenoType MTBDRplus, v.2 дав можливість встановити стійкість до рифампіцину у 35,7 % (р ˂ 0,05) пацієнтів, у яких не визначалася стійкість. Хибно-позитивні та хибно-негативні результати зумовлені, можливо, гетерогенністю штамів мікобактерій туберкульозу у клінічних зразках, відсутністю життєздатних мікобактерій, відсутністю фенотипічних проявів генетичних мутацій мікобактерій туберкульозу, помилками під час дослідження тощо. Чутливість тесту GenoType MTBDRplus, v.2 становить майже 78 %, але специфічність сягає 97 %. Натомість чутливість тесту щодо встановлення мультирезистентності сягає 100 %, специфічність – майже 89 %. Більша прогностична цінність позитивного результату для випадків, у яких визначаються ДНК МБТ, а прогностична цінність негативного результату – для випадків, у яких визначається мультирезистентність.

Висновки. Застосування тесту GenoType MTBDRplus, v.2. поряд із культуральним методом дослідження має високу діагностичну цінність, високу чутливість (100 %) і специфічність (89 %) щодо визначення мультирезистентності й дає змогу отримати результат у коротший термін порівняно з культуральним дослідженням.


Ключові слова


туберкульоз; діагностичні технології; тест genotype; ефективність

Посилання


Pustovyi, Yu. H., Baranova, V. V., Hritsova, N. A., & Dolynska, M. H. (2013). Vykorystannia molekuliarno-henetychnoho metodu GENOTYPE® MTBDRPLUS dlia rannoi diahnostyky multyrezystentnoho tuberkulozu [Using of molecular genetic methods GENOTYPE® MTBDRPLUS for early diagnosis of MDR TB]. Ukrainskyi pulmonolohichnyi zhurnal, 3, 130. [in Ukrainian].

Barbova, A. I., Zhurylo, O. A., Zherebko, N. M., & Chaika, A. O. (2014). Poriadok vykorystannia molekuliarno-henetychnykh metodiv u laboratoriiakh z diahnostyky tuberkulozu v Ukraini [The procedure of using molecular genetic techniques in the laboratory diagnosis of tuberculosis in Ukraine]. Kyiv. [in Ukrainian].

Nosova, E. Y., Krasnova, M. A., Galkina, K. Y., Makarova, M. V., Litvinov, V. I., Moroz, A. M. (2013). Sravnitel'naya ocenka e´ffektivnosti molekulyarnykh test-sistem «TB-Biochip», «Xpert MTB/Rif» i «GenoType MTBDRplus» dlya bystrogo opredeleniya mutacij, otvetstvennykh za lekarstvennuyu ustojchivost' Mycobacterium tuberculosis complex (v respiratornom materiale pacientov Moskovskogo regiona) [Comparative analysis of TB-Biochip, Xpert MTB/RIF, and GenoType MTBDRplus test systems for rapid determination of mutations responsible for drug resistance of M. tuberculosis complex (in sputum from patients in Moscow region)]. Molekulyarnaya biologiya, 47(2), 236–241. [in Russian].

Zhurylo, O. A., Barbova, A. I., Hlushkevych, T. H., & Tretiakova, L. V. (2012). Standarty bakteriolohichnoi diahnostyky tuberkulozu v laboratoriiakh protytuberkuloznykh zakladiv Ukrainy [The standards of bacteriological diagnosis of tuberculosis in the laboratory TB facilities in Ukraine: study guide]. Kyiv. [in Ukrainian].

Alenova, A. X., Abyldaev, T. Sh., Zhumadylov, Zh. Sh., Berykova, E. A., Terlykbaeva, A. M., Berykxanova, K. E., et al. (2013). Struktura i algoritmy novejshikh molekulyarno-geneticheskikh tekhnologij e´kspress diagnostiki tuberkuleza i lekarstvennoj ustojchivosti v Respublike Kazahstan [Structure and algorithms of the newest molecular genetic technologies for the rapid diagnosis of tuberculosis and drug resistance in the Republic of Kazakhstan]. Almaty. [in Russian].

Seifert, M., Ajbani, K., Georghiou, S. B., Catanzaro, D., Rodrigues, C., Crudu, V., et al. (2016). A performance evaluation of MTBDRplus version 2 for the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis. The international journal of tuberculosis and lung disease, 20(5), 631–637. doi: 10.5588/ijtld.15.0788.

Lyu, J., Kim, M. N., Song, J. W., Choi, C. M., Oh, Y. M., Lee, S. D., et al. (2013). GenoType® MTBDRplus assay detection of drug-resistant tuberculosis in routine practice in Korea. The international journal of tuberculosis and lung disease, 17(1), 120–124. doi: 10.5588/ijtld.12.0197.

European centre for disease prevention and control (2016) Handbook on TB laboratory diagnostic methods for the European Union. Stockholm.

Simons, S. O., Van der Laan, T., De Zwaan, R., Kamst, M., Van Ingen, J., Dekhuijzen, P. N. R., et al. (2015). Molecular drug susceptibility testing in the Netherlands: performance of the MTBDRplus and MTBDRsl assays. The international journal of tuberculosis and lung disease, 19(7), 828–833. doi: 10.5588/ijtld.15.0043.

Singh, L. S., Mazumder, P. B., & Sharma, G. D. (2014). Analysis of mutational pattern in multidrug resistant tuberculosis (MDR TB) in a geographically isolated northeastern region of India. IOSR Journal of Pharmacy and Biological Sciences, 9(1), 04–10. doi: 10.9790/3008-09130410.




DOI: https://doi.org/10.14739/2310-1237.2017.2.109670

Посилання

  • Поки немає зовнішніх посилань.


ПАТОЛОГІЯ   Лицензия Creative Commons
Запорізький державний медичний університет